HKEY_LOCAL_MACHINE.txt
とかに書く、
REG_SZ 行の最後に #2300 など、記載方法にしきたりが。
しきたり解説ドキュメントはこちら。
http://www.vmware.com/pdf/thinapp_virt_registry.pdf
なお、デフォルト（default）のRegistry Isolation Modeは、以下のようだ。
===マニュアルからの抜粋＝＝＝
キャプチャ プロセスではこのパラメータの値は設定されません。レジストリ分離モードは Package.ini ファイルのみで構成できます。ThinApp では、初期のレジストリ分離モードは WriteCopy に設定されてい ます。
===
http://www.vmware.com/pdf/thinapp47_packageini_reference.pdf
